Options
A new conception of polymeric supports for the solid phase peptide synthesis: rigidity and porosity as determinant factors for the success in industrial applications
Cantone, Sara
2008-03-10
Contributor(s)
Basso, Alessandra
Abstract
In questo studio di tesi sono stati sviluppati ed ottimizzati nuovi supporti rigidi per la sintesi in fase
solida in collaborazione con l’azienda Resindion srl. (Mitsubishi Chemical Corporation).
Tali supporti, denominati Synbeads, sono stati poi caratterizzati dal punto di vista chimico e fisico
ed applicati alla sintesi peptidica in fase solida.
La parte iniziale dello studio si è concentrata sulla messa a punto del processo di polimerizzazione
in modo da ottenere dei polimeri Synbeads caratterizzati da un grado di porosità ottimale e da una
omogenea distribuzione del diametro particellare.
Questi due parametri infatti influiscono notevolmente sull’applicabilità dei polimeri per sintesi su
fase solida:
- il grado di porosità, nei polimeri rigidi e che quindi non rigonfiano in solvente, deve
garantire un buon trasferimento di massa dei reagenti e nello stesso tempo assicurare una
buona resistenza dei polimeri stessi allo stress meccanico
- la distribuzione particellare deve essere compresa in un ben definito range di diametro, in
modo da permettere l’utilizzo dei Synbeads anche in sistemi automatizzati, senza che vi
siano presente né particelle fini che potrebbero intasare i filtri, né particelle di dimensioni
troppo grandi che potrebbero rendere difficoltoso il trasferimento delle stesse nei sistemi
automatici.
La successiva fase di ottimizzazione dei Synbeads si è concentrata su altri due parametri molto
importanti, ossia la lunghezza dello spaziatore tra la matrice polimerica e il gruppo funzionale e la
densità di gruppi funzionali presenti sui polimeri:
- una distanza ottimale del gruppo funzionale dalla matrice del polimero ne garantisce la
completa accessibilità chimica, evitando problematiche legate all’ingombro sterico
- la densità di gruppi funzionali deve assicurare sia una buona capacità di carico (mmoli di
gruppi funzionali per gdry di polimero) sia una completa accessibilità chimica di tutti i gruppi
funzionali presenti sul polimero.
In seguito a questo studio di ottimizzazione sono stati preparati i Synbeads con gruppo funzionale
amminico (Synbeads A310).
Partendo quindi dalle caratteristiche chimico-fisiche ottimizzate per la produzione dei Synbeads
A310, sono stai messi a punto dei protocolli per la preparazione e la caratterizzazione dei altri
Synbeads recanti gruppi funzionali diversi, ossia clorometilenici, bromometilenic, carbossilici ed
idrossilici.
Successivamente, i Synbeads A310 sono stati funzionalizzati con diversi linker che ne permettano
applicazioni diverse nella sintesi in fase solida.
Infatti, i Synbeads recanti i linker sono stati utilizzati per la preparazione da diversi
Fmoc-AA-Wang-Synbeads e per la sintesi di un pentapeptide. Questo pentapeptide costituisce la
sequenza dei primi cinque aminoacidi del Fuzeon®, un peptide che presenta attività inibitoria nei
confronti dell’HIV.
L’applicazione dei Synbeads è stata studiata anche per quanto riguarda il loro possibile utilizzo
nella sintesi peptidica automatizzata con l’impiego di microonde, in particolare nel sistema Liberty
CEM®. Grazie alle caratteristiche chimico-fisiche dei Synbeads e alla messa a punto di protocolli
sintetici adatti a questi polimeri rigidi, si è potuto ottenere il prodotto desiderato con buone rese e un
elevato grado di purezza.
Nella parte finale di questo studio di tesi è stata indagata la distribuzione dei gruppi funzionali
all’interno della matrice dei Synbeads.
Combinando la tecnica ATR-FT IR con luce convenzionale e con luce di sincrotrone è possibile
seguire la diffusione dei reagenti all’interno della matrice polimerica e verificare l’omogeneità della
matrice stessa.
Dopo aver messo a punto questa metodologia analitica, che permette un’indagine approfondita di
ciò che avviene all’interno della matrice dei polimeri rigidi non trasparenti, un altro approccio
analitico è stato sviluppato. Al fine di poter verificare in modo più rapido l’omogeneità della
matrice polimerica, sezioni di Synbeads funzionalizzati con diverse concentrazioni di fluoresceina
sono stati analizzati, permettendo in tal modo di verificare anche la distribuzione dei gruppi
funzionali.
Questo studio di dottorato quindi ha permesso di ottenere una nuova classe di polimeri rigidi per la
sintesi su fase solida, i Synbeads, che hanno dimostrato di permettere l’ottenimento di ottimi
risultati sia nella sintesi classica che in quella assistita da microonde.
Nuovi approcci analitici sono stati studiati e applicati per verificare l’omogeneità della matrice
polimerica e seguire i fenomeni di diffusione all’interno della matrice stessa.
In tal modo, i Synbeads presentano un ottimo potenziale per un’applicazione su larga scala in
processi industriali.
Insegnamento
Publisher
Università degli studi di Trieste
Languages
en
File(s)